Σήμερα ο ΠΑΟΚ είναι άρρηκτα συνδεδεμένος με τον Δικέφαλο Αετό, το εμβληματικό σύμβολο που παραπέμπει στις ρίζες της Κωνσταντινούπολης και στην προσφυγική καταγωγή του συλλόγου.

Ωστόσο, στα πρώτα του βήματα, το επίσημο έμβλημα δεν ήταν αυτό που γνωρίζουμε σήμερα.

Σύμφωνα με ιστορικές αναφορές, το αρχικό σήμα του ΠΑΟΚ απεικόνιζε ένα τετράφυλλο τριφύλλι σε συνδυασμό με πέταλο. Η έμπνευση αποδίδεται στον Κώστα Κοεμτζόπουλο, ένα από τα ιδρυτικά μέλη του συλλόγου, ο οποίος φέρεται να άντλησε την ιδέα από ένα πακέτο τσιγάρων της εποχής με την ονομασία «Λήθη».

Μετά τη Μικρασιατική Καταστροφή και την εγκατάσταση Κωνσταντινουπολιτών προσφύγων στη Θεσσαλονίκη, δημιουργήθηκε ο πυρήνας που οδήγησε στην ίδρυση του ΠΑΟΚ. Το 1926 κατατέθηκε το ιδρυτικό καταστατικό του «Πανθεσσαλονίκειου Αθλητικού Ομίλου Κωνσταντινουπολιτών», ενώ το πρώτο καταγεγραμμένο έμβλημα περιγραφόταν ως ένα πράσινο τετράφυλλο τριφύλλι με τα γράμματα Π, Α, Ο και Κ και ένα πέταλο ως στοιχείο προστασίας και τύχης.

Το αρχικό αυτό σύμβολο συνδεόταν με έννοιες όπως η ελπίδα, η πίστη και η καλή τύχη, πριν αντικατασταθεί σταδιακά από τον Δικέφαλο Αετό που καθιερώθηκε ως το σημερινό διαχρονικό σήμα του συλλόγου.