Η Μεσόγειος ξεχωρίζει για τα έντονα γαλάζια και τιρκουάζ νερά της, όμως το ιδιαίτερο χρώμα της δεν οφείλεται σε έναν μόνο λόγο. Είναι αποτέλεσμα πολλών φυσικών παραγόντων που συνδυάζονται.

Το βασικό στοιχείο είναι η καθαρότητα του νερού. Η Μεσόγειος έχει σχετικά λίγους μεγάλους ποταμούς που μεταφέρουν μεγάλες ποσότητες λάσπης και οργανικών υλικών στη θάλασσα.

Όσο λιγότερα αιωρούμενα σωματίδια υπάρχουν στο νερό, τόσο περισσότερο το φως διεισδύει σε μεγαλύτερο βάθος και το μπλε χρώμα γίνεται πιο έντονο.

Ένας ακόμη παράγοντας είναι η χαμηλή ποσότητα φυτοπλαγκτού σε πολλές περιοχές της. Το φυτοπλαγκτόν μπορεί να δώσει στις θάλασσες πρασινωπές αποχρώσεις, επειδή περιέχει χλωροφύλλη και επηρεάζει τον τρόπο με τον οποίο απορροφάται και ανακλάται το φως.

Το βαθύ μπλε της Μεσογείου σχετίζεται επίσης με τη γεωγραφική της θέση. Η έντονη ηλιοφάνεια της περιοχής βοηθά το φως να φτάνει βαθιά στο νερό. Το νερό απορροφά περισσότερο τα κόκκινα και κίτρινα μήκη κύματος του φωτός, ενώ το μπλε αντανακλάται περισσότερο προς τα μάτια μας.

Σε πολλές ελληνικές ακτές, το χρώμα γίνεται ακόμη πιο εντυπωσιακό λόγω του λευκού βυθού από άμμο ή ασβεστολιθικά πετρώματα.

Το φως αντανακλάται στον πυθμένα και δημιουργεί τις χαρακτηριστικές γαλάζιες και τιρκουάζ αποχρώσεις που βλέπουμε σε ρηχά νερά.

Αντίθετα, θάλασσες όπως ο Ατλαντικός ή περιοχές κοντά στις εκβολές μεγάλων ποταμών συχνά εμφανίζονται πιο σκούρες ή πρασινωπές, επειδή περιέχουν περισσότερα ιζήματα και μεγαλύτερες ποσότητες οργανικής ύλης.

Έτσι, το μοναδικό χρώμα της Μεσογείου είναι αποτέλεσμα της καθαρότητας των νερών, της ηλιοφάνειας, της σύστασης του βυθού και της περιορισμένης παρουσίας υλικών που αλλοιώνουν την απόχρωση της θάλασσας.